Historiquement, Ngoundiane appartient à l'ancien royaume du Baol dont elle constitue avec une partie du Diobass, les marges occidentales. Ses premières habitations seraient originaires de Diéguéme et ont transité par Khombole avant de se réfugier dans cet espace géographique qui était protégé (Ngol en sérère), actuel Guith Mbaal.

Cette migration était causée par la traite des esclaves mais surtout les exactions et les pillages de leurs récoltes. D'après les mêmes sources, Diack était aussi occupé au même moment.

Au cours des périodes, les habitations ont rapidement évolué due à une croissance démographique très élevée. Constituée essentiellement d'agriculteurs et de pasteurs, cette population va coloniser provisoirement les terres environnantes qui constitueront les futurs villages de la communauté rurale de Ngoundiane.

Le processus de peuplement de la collectivité territoriale est profondément tributaire des vicissitudes de la vie politique de ce royaume. En effet, l'instauration d'un pouvoir monarchique par la violence guerrière, la dépossession, la servitude infligée aux populations et les autres pratiques similaires sont des caractéristiques des royaumes précoloniaux qui ont affecté les équilibres sociaux, occasionnant ainsi des migrations vers des zones de refuge.

Dans un tel contexte, plusieurs populations sont parties du cœur du Baol pour se diriger vers l'Ouest à la recherche de meilleures conditions de vie. Au cours de leurs pérégrinations, ils fondèrent bon nombre de localités dont certaines appartiennent à l'actuelle commune de Ngoundiane.